「ソニックバトル」の基本となる ストーリーモード。 ストーリーモードに登場する「エメル」は物語の中でさまざまな経験を通しソニックたちのワザを覚え、キャプチャーしていく！

キャプチャーしたワザは、「スキルポイント」を消費する数が決まっている。 エメルはバトルで「スキルポイント」を手にいれ自分の持っている「スキルポイント」の範囲でキャプチャーしたワザを選び、組み合わせるんだ！ 　 　 　 ここでキャプチャーをして組み合わせたワザはストーリーモード以外でも「キミのエメル」としてそのまま使うことができるぞ！