『F-ZERO AX』の1プレイ分の料金を投入し、『F-ZERO GX』のゲームデータが入った「ゲームキューブメモリーカード」と「特製F-ZEROライセンスカード」をそれぞれのスロットに挿入します。
ライセンスカードを先に挿入すると、メモリーカードのロードやセーブが行われません。
ゲームが終了すると、ライセンスカードに記録されているスペシャルマシンのマシンパーツがメモリーカードにダウンロードされます。
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セーブ中に急な停電などで筐体の電源が切れてしまうと、メモリーカード内のデータが消えてしまうおそれがあります。そのような不測の事態に備えてメモリーカードには『F-ZERO GX』以外のゲームのゲームデータは入れないで使用することをお勧めします。また、プレイ中にメモリーカードを抜き差しすると、データが壊れるおそれがありますので、絶対におやめ下さい。
パーツがダウンロードされたメモリーカードを使って『F-ZERO GX』をプレイすると、カスタマイズモード内のF-ZEROショップにスペシャルマシンパーツが出現しています。